More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1208 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 117 aa  240  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  58.56 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  55.75 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  53.98 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  54.87 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  54.05 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.68 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  53.15 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  51.38 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  53.57 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  56.76 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  55.96 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  53.57 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50.45 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  48.62 
 
 		 122 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  51.35 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  52.25 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.62 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  49.54 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  49.54 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  49.11 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  49.09 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.09 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  54.95 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  48.62 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  49.07 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  49.09 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  52.21 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  52.25 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  53.64 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  46.79 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  46.79 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  47.22 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  47.22 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  49.55 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  52.25 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  50.45 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  52.73 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  49.07 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  45.87 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  45.37 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  46.79 
 
 		 126 aa  100  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  49.09 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  45.13 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  45.87 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 115 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 125 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  44.55 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>