More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3159 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  254  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  69.92 
 
 		 125 aa  173  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  68.29 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 127 aa  148  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  58.82 
 
 		 124 aa  147  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  56.91 
 
 		 125 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  58.27 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  56.1 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 136 aa  131  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  50.81 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 129 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  53.66 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  54.33 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  52.03 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 129 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  51.61 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  51.64 
 
 		 126 aa  121  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 128 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  47.15 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  50.83 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  49.61 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.26 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  45.24 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1300  endoribonuclease L-PSP  57.94 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 124 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  42.86 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  50.83 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  51.24 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 127 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  42.4 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  49.19 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  50.79 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  48.8 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2549  endoribonuclease L-PSP  56.35 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>