More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08201 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  100 
 
 		 132 aa  266  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  79.37 
 
 		 129 aa  207  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  75.76 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  64.89 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  64.89 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  62.88 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  57.48 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  55.12 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 130 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  57.6 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  60.32 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  53.17 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  59.06 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 131 aa  137  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 130 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  53.17 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  48.87 
 
 		 227 aa  130  7.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  50.41 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 128 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  54.4 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 126 aa  117  6e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  51.64 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 124 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 126 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  116  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  48.06 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  45.16 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 128 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  48.78 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  46.77 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  44.88 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 133 aa  110  4.0000000000000004e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  43.65 
 
 		 130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  47.15 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  48.41 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 129 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>