More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0574 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  266  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  81.54 
 
 		 126 aa  214  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  81.54 
 
 		 126 aa  214  4e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  55.38 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  53.85 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 126 aa  147  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  53.08 
 
 		 126 aa  146  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  52.31 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  55.47 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  53.79 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  51.54 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  52.27 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  53.97 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  53.12 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.31 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  46.51 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  52.31 
 
 		 129 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  51.56 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  51.54 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  51.22 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  51.94 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  48.41 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  48.03 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  47.24 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  48.48 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.85 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  47.66 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  47.15 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 129 aa  120  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.67 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  44.27 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  44.27 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 126 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  47.58 
 
 		 129 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  49.18 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  43.94 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  50 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  47.2 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  46.92 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  48.12 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  45.6 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  50.76 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>