More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0566 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  56.56 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  55.2 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  59.5 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  57.38 
 
 		 127 aa  147  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  58.68 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  55.74 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  56.2 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  57.02 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  57.72 
 
 		 128 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  52.89 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.89 
 
 		 128 aa  139  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  54.1 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  53.72 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 127 aa  137  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  52.89 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  52.07 
 
 		 127 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  54.55 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  51.2 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  52.46 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  55.93 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  52.07 
 
 		 127 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  52.07 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  56.45 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 127 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  47.93 
 
 		 151 aa  126  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  50.85 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  47.5 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0470  endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.720081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 129 aa  117  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.69 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 125 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  49.61 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.08 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  45.45 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  46.77 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  47.9 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  46.4 
 
 		 129 aa  110  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  43.8 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  50.86 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>