More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1512 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 		 127 aa  156  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 129 aa  146  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 140 aa  130  7.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  51.72 
 
 		 126 aa  129  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  55.75 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 127 aa  123  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  53.45 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  50.88 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  50.42 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  48.76 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  46.49 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 128 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.21 
 
 		 126 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  45.53 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  47.93 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  50.82 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 123 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 127 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  44.54 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  49.59 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  43.48 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  43.44 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  44.35 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  43.55 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  43.48 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  49.59 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  48.72 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>