More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25710 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 130 aa  259  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  61.72 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  52.24 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  51.54 
 
 		 133 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  51.15 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  46.88 
 
 		 129 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.62 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  42.75 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  41.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  41.22 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  43.51 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  43.51 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 128 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  44.44 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  42.75 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  43.08 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  46.83 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  44.88 
 
 		 129 aa  104  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  42.64 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 127 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 128 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  46.27 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 127 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  41.73 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.66 
 
 		 126 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  39.53 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  43.85 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  41.22 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  39.69 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  42.31 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  43.65 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  40.62 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  44.27 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  48.85 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 128 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  43.94 
 
 		 132 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  40.46 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  41.22 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  46.83 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  44.53 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  44.36 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  41.41 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.27 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  48.82 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 125 aa  97.4  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  44.53 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  37.21 
 
 		 127 aa  95.9  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  42.06 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  45.74 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  41.48 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  42.64 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>