More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1030 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  76.92 
 
 		 133 aa  206  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 134 aa  183  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  67.91 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  51.91 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  36.84 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  37.5 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  34.85 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 125 aa  91.3  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  45.04 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.77 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  39.39 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.4 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  38.76 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.62 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  41.79 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.56 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  34.11 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  38.58 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  39.71 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  34.85 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  38.71 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  36.22 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  38.17 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  32.58 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  36.43 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  36.22 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>