More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0613 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1892  endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 127 aa  126  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 123 aa  94.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  91.3  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  42.73 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  42.86 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 129 aa  88.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  45.71 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  38.52 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 124 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.59 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.92 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  40.52 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  38.39 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  42.2 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.96 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  38.79 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  40.35 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  40.35 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  41.94 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  39.17 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>