More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3898 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  93.5 
 
 		 123 aa  226  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  93.5 
 
 		 123 aa  226  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  60.91 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  60.91 
 
 		 129 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  60.91 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  57.27 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  57.27 
 
 		 125 aa  136  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  51.4 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  51.85 
 
 		 125 aa  117  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 166 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  48.18 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  52.34 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  48.62 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  52.34 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.4 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3322  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 94 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939467  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  49.53 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 133 aa  107  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  49.07 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  50.91 
 
 		 128 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  49.07 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  51.85 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 125 aa  103  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  48.15 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45.79 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  45.79 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  45.79 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  47.22 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  51.38 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  42.2 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  45.37 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  38.79 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  45.6 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  42.59 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  43.9 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  45.79 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  45.28 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 125 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.27 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  44.04 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  44.34 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  47.71 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.27 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  46.3 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  47.22 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>