More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_920 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  100 
 
 		 138 aa  284  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  91.94 
 
 		 125 aa  243  8e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  88 
 
 		 125 aa  229  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  45.38 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.37 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  44.88 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  44.88 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  43.1 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  47.06 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  40.98 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.35 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  43.22 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 116 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  43.09 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  39.64 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  41.07 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  39.13 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  38.21 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  47.12 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  43.1 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  42.11 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  42.11 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  39.82 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  34.43 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  41.38 
 
 		 127 aa  84.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>