More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3238 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 151 aa  309  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 125 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  41.46 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  42.06 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  45 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  43.55 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  39.02 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 128 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.21 
 
 		 132 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 128 aa  97.1  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 125 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 125 aa  95.9  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  36.8 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  40.48 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 134 aa  94.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  38.4 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  37.1 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  34.88 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.46 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.66 
 
 		 127 aa  91.3  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  38.26 
 
 		 128 aa  90.9  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  40.34 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  37.4 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  42.61 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  42.61 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  39.5 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 227 aa  90.1  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  39.02 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  39.5 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  40.34 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>