More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3322 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3322  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 94 aa  196  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939467  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  84.95 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  70.97 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  68.82 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  58.62 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  58.62 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  59.55 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  55.91 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  44.94 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 123 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  50.56 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  47.25 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  49.44 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  48.89 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  46.59 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  44.94 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  45.35 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.11 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  47.78 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  49.46 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  43.02 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  51.11 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  46.43 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  45.35 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  51.76 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  42.22 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  45.56 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0969  endoribonuclease L-PSP  44.87 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401025  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  39.53 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  44.71 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  45.56 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  48.86 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  42.7 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  41.3 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  43.68 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  49.43 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.96 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.22 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  42.39 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  43.9 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.05 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.81 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4897  putative endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  42.35 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  41.76 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  45.05 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  46.84 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  44.05 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>