More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1554 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  54.03 
 
 		 126 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  48.03 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  43.85 
 
 		 130 aa  100  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  40.83 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  47.86 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  51.35 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 131 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.72 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  42.86 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  43.9 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  44.19 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  38.14 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  40.8 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 125 aa  88.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  39.34 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  36.43 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  40.65 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  42.73 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  40.57 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  37.98 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  44.86 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  38.02 
 
 		 129 aa  87.4  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.09 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  37.17 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 227 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  42.64 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>