More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01480 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  47.15 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  45.53 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00590  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  45.61 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02050  conserved hypothetical protein  43.1 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.385161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  43.08 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  42.98 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  41.53 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  44.09 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  40.16 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.09 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  39.84 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  41.32 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  40.48 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  40.5 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  38.76 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  38.28 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  42.48 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 123 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  41.23 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  41.59 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 135 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  40.16 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  39.17 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  41.59 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  39.06 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>