More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02050 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02050  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  270  5.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.385161  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  42.62 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  43.1 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00590  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  38.1 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  36.72 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  38.46 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  35.4 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 150 aa  67  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  34.51 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5320  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.17 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  30.71 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.59 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1123  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  33.96 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  36.79 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  35.25 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  37.14 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0543  putative endoribonuclease L-PSP  41.77 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  33.88 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>