More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6508 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  265  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  71.43 
 
 		 149 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  64.34 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  65.32 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  61.29 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 129 aa  137  6e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0138  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 137 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.34 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.54 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  32.76 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01480  Brt1, putative  33.6 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.683289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  38.53 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  33.62 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  35.34 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  32.17 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  37.93 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.17 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  31.3 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  33.9 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  29.31 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  35.65 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  33.9 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.52 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  33.06 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>