More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0749 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00590  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  38.64 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0239835  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 144 aa  93.2  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  37.27 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  37.19 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  41.23 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  39.13 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.34 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  37.93 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 227 aa  83.6  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  36.89 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 129 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  36.21 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  37.96 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.7 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  39.83 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5083  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000803015  normal  0.0820919 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.7 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  36.75 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  36.08 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  37.07 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  36.67 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.45 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.75 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  38.94 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>