More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0291 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
145 aa  295  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  66.14 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  57.85 
 
 
134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  57.85 
 
 
134 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 
126 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
151 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 
126 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  38.28 
 
 
151 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  35.9 
 
 
148 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  38.79 
 
 
128 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 
127 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 
126 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
126 aa  99.8  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 
124 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 
129 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  44.27 
 
 
126 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 
124 aa  97.4  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
127 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  39.66 
 
 
126 aa  97.1  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  41.53 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 
125 aa  96.7  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 
126 aa  94.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 
129 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 
128 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 
125 aa  93.2  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  39.17 
 
 
126 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  34.82 
 
 
126 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 
150 aa  92  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
127 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  37.39 
 
 
124 aa  92  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  41.74 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.71 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  37.29 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  43.65 
 
 
129 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  40.18 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  39.13 
 
 
126 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  35.65 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  37.19 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.79 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 
141 aa  88.6  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 
124 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  37.8 
 
 
129 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  36.21 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  37.93 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 
129 aa  88.2  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 
128 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 
127 aa  86.7  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  38.39 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  47.22 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  37.07 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 
173 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 
129 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  34.48 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>