More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5421 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  78.4 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  75.2 
 
 		 125 aa  176  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  64.34 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 129 aa  165  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  58.4 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0138  endoribonuclease L-PSP  62.99 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  48 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  41.38 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  37.07 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  38.14 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  42.02 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  37.07 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.38 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.94 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  30.4 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  31.93 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.69 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.77 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  35.34 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  33.87 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.4 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  33.87 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.52 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>