More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2982 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  100 
 
 		 125 aa  254  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  92.74 
 
 		 125 aa  211  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  78.4 
 
 		 133 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  65.32 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  61.79 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0138  endoribonuclease L-PSP  64.52 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  57.72 
 
 		 143 aa  150  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  47.46 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  37.07 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  38.79 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  43.22 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  38.46 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  41.38 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  34.19 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.89 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  37.61 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  38.46 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.17 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  39.32 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 117 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  36.52 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35.34 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0560  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0179  endoribonuclease L-PSP, putative  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0838  YjgF family protein  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2390  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2768  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0660  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.239315  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0675  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>