More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0720 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  263  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5421  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 133 aa  165  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0138  endoribonuclease L-PSP  62.02 
 
 		 131 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6940  Endoribonuclease L-PSP  66.13 
 
 		 125 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2982  putative translation initiation inhibitor  65.32 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  52.76 
 
 		 143 aa  139  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6508  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 127 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.13 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 128 aa  85.9  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  45.76 
 
 		 123 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  36.75 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.94 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  39.5 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  34.45 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  43.7 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  38.98 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  34.96 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  40.8 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  38.98 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35.43 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  34.11 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.13 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  34.45 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  33.05 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.88 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  37.29 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  35.16 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.48 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.9 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>