More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4818 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  253  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  52.03 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 132 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  50.82 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  51.35 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 125 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  44.04 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.26 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  39.34 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  33.88 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0720  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0884731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  34.43 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.54 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.67 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6129  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  42.86 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  35.54 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.96 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  32 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  34.48 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  37.61 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  35.34 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  34.71 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>