More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0752 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  257  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  110  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 126 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 124 aa  102  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  41.32 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  44.83 
 
 		 132 aa  100  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  38.71 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 127 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  41.74 
 
 		 124 aa  97.1  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.9 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  37.9 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  38.71 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.51 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  37.1 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 227 aa  94  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  94  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  38.33 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  42.24 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.29 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  40.98 
 
 		 135 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 133 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.35 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  36.51 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  41.03 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  38.71 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  37.7 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  39.34 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  38.71 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 127 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>