More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0972 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  66.42 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  61.21 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  61.21 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  61.74 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  60.83 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  53.17 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  55.46 
 
 		 130 aa  123  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  46.61 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  43.64 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  47.22 
 
 		 132 aa  93.6  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 124 aa  93.2  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  41.88 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  41.88 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  38.66 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 125 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.21 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  38.05 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  36.13 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  84.3  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  36.13 
 
 		 161 aa  83.6  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  33.9 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.65 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  34.78 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  39.13 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.96 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  34.48 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>