More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1452 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  100 
 
 		 127 aa  266  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  67.72 
 
 		 132 aa  189  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 125 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  39.13 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  38.74 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  37.7 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 387 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  36.07 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  36.7 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  27.64 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  31.97 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  31.15 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.9 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  35.78 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  32.79 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  27.97 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  29.6 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  37.72 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  27.97 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>