More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3641 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  100 
 
 		 130 aa  258  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  82.31 
 
 		 132 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  50.82 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  49.21 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  49.56 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  50.46 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  55.46 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  45.9 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 126 aa  97.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  37.7 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  38.33 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  40.32 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.82 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 387 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  38.02 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.25 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  33.33 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.43 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  35.54 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.77 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  31.09 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  35.59 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>