More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3697 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  50.4 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  47.62 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  49.55 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  41.8 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  41.27 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  37.19 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  38.14 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.5 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  38.21 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2314  YjgF-like protein  39.02 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  40.37 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  35.29 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.54 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  34.75 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  39.06 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  38.02 
 
 		 125 aa  84.3  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  36.44 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  34.96 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  38.84 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  38.02 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  38.66 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.61 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  30.4 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>