More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3399 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  82.31 
 
 		 130 aa  224  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  53.66 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  50.79 
 
 		 130 aa  121  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 129 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  49.56 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  53.39 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  42.98 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  38.52 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  39.84 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 125 aa  84.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.29 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.43 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  37.7 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.25 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  31.45 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.75 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  32.31 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.82 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0357  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00527339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.94 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  33.61 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.26 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>