More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2433 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 125 aa  255  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.52 
 
 		 127 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 128 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  41.13 
 
 		 126 aa  90.1  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  89.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  42.62 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  38.84 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  40.32 
 
 		 151 aa  87.4  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  43.62 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  40.32 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 151 aa  84.3  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  44.04 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  34.23 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  35.77 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  36.13 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.29 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  37.29 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  37.4 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  36.36 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  44.04 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  37.27 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  34.68 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  37.9 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  35.25 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  38.74 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  38.89 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  35.48 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>