More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  66.67 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  44.19 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  42.64 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  45.38 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 125 aa  102  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  41.09 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  39.53 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  51.85 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  42.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  43.81 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  41.6 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 129 aa  98.6  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  45.37 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  38.4 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 227 aa  98.2  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  44.95 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 125 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 128 aa  96.7  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  47.97 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  44.53 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  41.22 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  42.31 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  42.97 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  42.74 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  43.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 130 aa  93.6  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  39.02 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 127 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 127 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  44.35 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  36.8 
 
 		 125 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  42.24 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.62 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  45.24 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 124 aa  91.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  37.17 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 125 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  48.54 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 123 aa  90.1  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 128 aa  90.5  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>