More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5489 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  254  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  66.67 
 
 		 126 aa  167  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  61.16 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  44.72 
 
 		 126 aa  97.1  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  94.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  42.28 
 
 		 130 aa  93.6  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  41.13 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  45.28 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  45.37 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 227 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  44.34 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  43.93 
 
 		 128 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  47.17 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  84.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.9 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.81 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  43.81 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  44.19 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  41.86 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  42.97 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  40.62 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  39.2 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  44.23 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1892  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  43.97 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  38.58 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  36.72 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  39.82 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  40.48 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.99 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  40.32 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  34.92 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  43.09 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  39.32 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>