More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1892 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1892  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 143 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 125 aa  100  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 126 aa  98.6  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  45.74 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 124 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  49.49 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  39.68 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2971  putative endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 125 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 140 aa  90.5  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 125 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  43.09 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  40.16 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2875  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.732397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  37.4 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 127 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  43.31 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2549  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  51 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  51 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1401  endoribonuclease L-PSP  49.6 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  39.84 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  39.84 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  40.71 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  41.59 
 
 		 135 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  42.19 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  44.55 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3069  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.431949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  40.71 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1297  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0602283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  41.23 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  39.09 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  37.9 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  41 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2310  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.650904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0547  endoribonuclease L-PSP, putative  38.74 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>