More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4880 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  57.6 
 
 		 123 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 125 aa  87.4  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  46.28 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  44.44 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  41.94 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1892  endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4201  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0467405  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2549  endoribonuclease L-PSP  49.24 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  39.17 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1401  endoribonuclease L-PSP  48.48 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.190303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1300  endoribonuclease L-PSP  48.48 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.558968  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  41.6 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  41.6 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.61 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  34.19 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  40.83 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  41.88 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  40.91 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  43.27 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  39.17 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  43.81 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  40 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2507  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.022272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2127  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2739  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2765  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2779  endoribonuclease L-PSP family protein  41.41 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  38.71 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.96 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4057  YjgF family translation inhibitor  32.65 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.655653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0642  Endoribonuclease L-PSP  32.65 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6067  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  39.52 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2789  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2656  endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3088  endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>