More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1115 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  100 
 
 		 129 aa  259  8e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  47.15 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  50 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  47.15 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  47.15 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 126 aa  110  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  46.4 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  45.97 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 140 aa  104  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 123 aa  103  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  45.53 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  45.53 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  43.09 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  42.62 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  45.6 
 
 		 130 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 124 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  41.13 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  43.09 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  39.37 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  38.58 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 125 aa  97.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 125 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  97.8  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  41.13 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 150 aa  97.1  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  40.31 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 121 aa  95.9  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  38.21 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  40.32 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  39.34 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 125 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 126 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  40.62 
 
 		 156 aa  93.6  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  43.55 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  42.98 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.2 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  43.59 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 130 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  42.15 
 
 		 125 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  40.16 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 132 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>