More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5477 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  62.83 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 136 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  53.79 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  51.13 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  38.46 
 
 		 130 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  46.4 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  38.46 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  39.69 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  44.17 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  38.52 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  40.16 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 131 aa  97.1  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  48.82 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  40.16 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  43.33 
 
 		 126 aa  95.9  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  38.52 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  37.7 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  38.1 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 126 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.8 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  41.46 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 150 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 127 aa  89.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  39.52 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  40.16 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  39.68 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  40.65 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  35.2 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 127 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 227 aa  87.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  39.52 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  35.16 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  87  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  32.8 
 
 		 127 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  40 
 
 		 129 aa  86.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>