More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4365 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  52.42 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  57.02 
 
 		 134 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 132 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  53.15 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  48.25 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 129 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  40.16 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  41.13 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 140 aa  96.7  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  45.13 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  42.28 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  39.34 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.65 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  41.18 
 
 		 128 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  38.52 
 
 		 128 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  36 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  38.71 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 129 aa  91.3  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  39.37 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 129 aa  90.5  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  38.28 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 124 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  39.84 
 
 		 129 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  38.28 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  40.32 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  87.8  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 129 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  35.71 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  38.21 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.13 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  35.2 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  40.16 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  36.97 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21490  endoribonuclease L-PSP, putative  40.16 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  34.4 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>