More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5909 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  65.67 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  62.69 
 
 		 134 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  57.38 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  61.74 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  48.46 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 125 aa  120  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  39.64 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 126 aa  87  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  35.77 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  41.12 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  36.15 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  38.74 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  34.13 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  35.71 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  37.96 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.11 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.61 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  31.06 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  34.21 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  38.94 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  34.09 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3753  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596421  hitchhiker  0.00368928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.78 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.23 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  32.41 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3079  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  29.37 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>