More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0268 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  100 
 
 		 132 aa  275  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  67.72 
 
 		 127 aa  189  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  41.07 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  38.33 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1192  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0291  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  47.22 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  31.15 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  32.38 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4475  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.67 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  30.17 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  32.08 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  40.57 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  37.74 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  33.05 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.91 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  26.4 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  26.4 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  28.93 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  31.36 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1512  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  33.62 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>