More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2055 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  263  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  263  4e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  97.69 
 
 		 130 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  89.84 
 
 		 128 aa  239  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  78.12 
 
 		 128 aa  215  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  74.8 
 
 		 127 aa  206  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  71.54 
 
 		 130 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  73.23 
 
 		 127 aa  203  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  73.44 
 
 		 129 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 		 128 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  70.08 
 
 		 127 aa  196  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  67.97 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  66.67 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 126 aa  100  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 128 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  41.09 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  37.72 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  42.72 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 124 aa  85.9  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 227 aa  83.6  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  34.4 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  33.88 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  36.61 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  42.2 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  42.2 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0742  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  37.84 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>