More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3980 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  266  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  79.69 
 
 		 128 aa  217  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  76.56 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  74.22 
 
 		 130 aa  206  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  73.44 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  73.44 
 
 		 130 aa  202  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  72.66 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  71.09 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  73.23 
 
 		 130 aa  197  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  70.87 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  70.87 
 
 		 127 aa  192  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  69.29 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  61.9 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 126 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  36.43 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  35.43 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  38.79 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 227 aa  83.6  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  34.13 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.09 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.13 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  33.33 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.96 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.65 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2239  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.98751  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  33.04 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.61 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  30.7 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.13 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  32 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  32.23 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  32.14 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>