More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3893 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  66.41 
 
 		 131 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  41.04 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4840  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 227 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  40.59 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  38.79 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.12 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  40.2 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  41.82 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.8 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0997  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1155  endoribonuclease L-PSP family protein  32.06 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  35.46 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  35.96 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  43.52 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  29.01 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  33.08 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  34.75 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0317  putative endoribonuclease L-PSP  47.56 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.77 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1077  Endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0180844  normal  0.0247338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  32.03 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2055  Endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1736  endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 149 aa  70.1  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>