More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2452 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
131 aa  266  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  90.08 
 
 
131 aa  243  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  90.08 
 
 
131 aa  242  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  90.08 
 
 
131 aa  241  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  89.31 
 
 
131 aa  241  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  89.31 
 
 
131 aa  240  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  89.31 
 
 
131 aa  240  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  88.55 
 
 
131 aa  237  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  88.64 
 
 
132 aa  237  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  86.26 
 
 
131 aa  230  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  43.55 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 
133 aa  87  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.17 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  39.85 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  39.85 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  39.85 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  38.71 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 
136 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  41.32 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  35.94 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.28 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  31.62 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.35 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  39.22 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  38.17 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  33.33 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  35.65 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  38.05 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  36.72 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  37.4 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  32.81 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.07 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>