294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2820 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 145 aa  290  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  74.26 
 
 		 136 aa  197  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  76.12 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  72.39 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  46.32 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  46.32 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  44.03 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  41.79 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  48.46 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 135 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  37.12 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.1 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.36 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  39.55 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  36.15 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  36.15 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  38.37 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.94 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  24.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  35.29 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  31.78 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  36.15 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  28.99 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  26.56 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  27.86 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  31.03 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  32.58 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>