222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1769 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  75.74 
 
 		 136 aa  210  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  71.32 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  68.15 
 
 		 136 aa  176  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  50.74 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  49.26 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  44.12 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 135 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 136 aa  107  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 135 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  42.02 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.82 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  67  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.77 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.77 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  29.85 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  32.85 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 377 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  27.54 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  31.5 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  37.04 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  36.21 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08290  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110171 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  31.85 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  36.36 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  35.24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  35.24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  35.24 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  27.59 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  36.36 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>