More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3130 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
131 aa  266  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  58.78 
 
 
132 aa  166  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  59.06 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 
130 aa  155  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  58.46 
 
 
130 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  55.38 
 
 
130 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  55.04 
 
 
137 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  56.59 
 
 
132 aa  154  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  55.91 
 
 
131 aa  151  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 
130 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 
130 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 
131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  54.14 
 
 
134 aa  147  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  51.54 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  51.88 
 
 
137 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 
142 aa  140  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 
130 aa  140  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  48.44 
 
 
132 aa  140  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  52.38 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 
131 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 
130 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  48.06 
 
 
148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  53.97 
 
 
142 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 
132 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 
133 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 
133 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 
133 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  31.54 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 
127 aa  72  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  40.68 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  34.21 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 
129 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  36.89 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.36 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  35.4 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.23 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.58 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  33.98 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 
118 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  32.76 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  23.85 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 
130 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  27.68 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 
127 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  35.96 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  26.15 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 
227 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  34.62 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>