290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2495 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  89.31 
 
 		 131 aa  237  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  81.68 
 
 		 131 aa  216  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  78.63 
 
 		 131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  80.15 
 
 		 131 aa  209  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  79.39 
 
 		 131 aa  202  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  77.1 
 
 		 133 aa  200  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  54.2 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 133 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.24 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  27.48 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  31.85 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.65 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  34.86 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  28.12 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.56 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  33.65 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  29.01 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4166  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  29.06 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  29.06 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.2 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  28.21 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4728  endoribonuclease L-PSP family protein  28.21 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  35.64 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  28.21 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  34.82 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4504  endoribonuclease L-PSP family protein  28.21 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.282438  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0093  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  32.08 
 
 		 402 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>