More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0512 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  266  5e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  47.24 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  46.46 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  46.92 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  44.07 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 394 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  46.49 
 
 		 402 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  43.7 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  46.73 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.06 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  34.65 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  40.95 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  41.28 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.32 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  37.61 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  43.4 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  42.06 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  33.02 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  42.45 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  35.92 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  38.53 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  38.53 
 
 		 140 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.08 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  31.13 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  39.25 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  41.41 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  40.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>