144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6797 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  265  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5209  Endoribonuclease L-PSP  61.76 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  42.42 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  39.23 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  39.23 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  38.41 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  48.48 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  39.13 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  45.45 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  33.08 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  35.88 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  41.25 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  30.23 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.53 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.16 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.09 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4880  Endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  34.27 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  32.53 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.05 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.05 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  26.28 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  33.67 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3526  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.269561  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.62 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.14 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3521  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.757048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3594  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.95 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  34.12 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.88 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.88 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>