183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  100 
 
 		 135 aa  262  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  77.78 
 
 		 136 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  79.84 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  64.34 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  60.19 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  58.78 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  60.19 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  40.17 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 135 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  35.37 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.35 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  24.6 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  25.22 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  22.96 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  25.22 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  29.1 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  27.83 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  33.01 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.69 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 377 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  30.38 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  25.24 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  24.24 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>